本報訊(記者張行勇)西北大學生命科學學院教授嚴健,、張亮,、陳居明帶領(lǐng)的西北大學與香港城市大學聯(lián)合研究團隊,,成功開發(fā)了一種檢測活細胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的新技術(shù),,并取名為CARPID ,可助力非編碼RNA研究,。相關(guān)研究成果近日在線發(fā)表于《自然—方法》,。
長鏈非編碼核糖核酸(lncRNA)被認為是基因組中的主要“暗物質(zhì)”。目前生物醫(yī)學界越來越多的研究表明,,這些RNA分子可能參與細胞內(nèi)一系列重要的生理活動,,與腫瘤發(fā)生發(fā)展也有著密切關(guān)系,如DNA突變引起腫瘤的發(fā)生,。而DNA突變可能會改變相關(guān)蛋白質(zhì)的序列和功能,,如造成信使RNA序列的改變等。
據(jù)團隊相關(guān)專家介紹,相較于以往的方法,,CARPID的優(yōu)勢在于它不需要經(jīng)過預先的小分子或者高能紫外線的交聯(lián),,而是在生理條件下檢測活細胞的lncRNA與蛋白質(zhì)相互作用,可以有效避免交聯(lián)所產(chǎn)生的系統(tǒng)性誤差,。此外,,由于其他方法幾乎都需要設(shè)計多個RNA探針來富集目標lncRNA,對于細胞中含量比較低或者長度比較短的lncRNA技術(shù)難度較大,。
CARPID大大提高了方法的敏感性,,也相對簡便。該技術(shù)具有廣泛的應(yīng)用前景,,包括尋找在腫瘤發(fā)生過程中具有重要作用的RNA結(jié)合蛋白,,以及用于發(fā)現(xiàn)新冠病毒RNA基因組侵入人體細胞后的重要結(jié)合蛋白,這些蛋白分子或許可以作為治療相關(guān)疾病的藥物靶點,。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1038/s41592-020-0866-0
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